Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms