Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms