Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD2P0DJD1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms