Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB1P08034 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB1P08034 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB1P08034 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms