Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms