Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG12O94817 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms