Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHP4O75161 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms