Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms