Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms