Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMBP2O15034 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMBP2O15034 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms