Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DFFAO00273 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DFFAO00273 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DFFAO00273 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DFFAO00273 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DFFAO00273 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DFFAO00273 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DFFAO00273 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DFFAO00273 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DFFAO00273 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DFFAO00273 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms