Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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