Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms