Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms