Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIPSLA2A3N6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms