Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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