Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
EHD3Q9NZN3 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms