Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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