Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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RTL3Q8N8U3 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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RTL3Q8N8U3 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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RTL3Q8N8U3 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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RTL3Q8N8U3 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL3Q8N8U3 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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