Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZBED9Q6R2W3 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZBED9Q6R2W3 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZBED9Q6R2W3 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZBED9Q6R2W3 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZBED9Q6R2W3 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
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