Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms