Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms