Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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ZFHX3Q15911 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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ZFHX3Q15911 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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