Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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