Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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