Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CUL1Q13616 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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