Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RIGQ13278 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
RIGQ13278 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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