Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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