Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRDNQ13061 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1052.5 ms