Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDC16Q13042 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms