Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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