Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
J3KRW8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
J3KRW8 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
J3KRW8 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3KRW8 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3KRW8 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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