Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP17L18D6R9N7 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP17L18D6R9N7 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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