Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM35Q9UPQ4 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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