Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms