Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms