Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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