Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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