Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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