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| ATP6AP1 | Q15904 | MED14P1-201 | ENST00000430517 | 648 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL23AP83-201 | ENST00000434984 | 473 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS15AP28-201 | ENST00000435088 | 386 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC084756.1-201 | ENST00000558237 | 606 nt | TSL 5 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | MIR5694-201 | ENST00000581190 | 76 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | GALNT1-205 | ENST00000591081 | 1120 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL451007.1-201 | ENST00000595491 | 289 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CERS6-AS1-209 | ENST00000609766 | 642 nt | TSL 5 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR6840-201 | ENST00000611937 | 71 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC122133.1-201 | ENST00000613964 | 233 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AF246928.1-201 | ENST00000623768 | 87 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OR8K3-203 | ENST00000641662 | 2438 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC010889.1-201 | ENST00000566193 | 2666 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ATP8A2P3-201 | ENST00000426792 | 1536 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RTL4-201 | ENST00000340433 | 2613 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CCDC82-202 | ENST00000423339 | 1878 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MT-ATP6-201 | ENST00000361899 | 681 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RN7SKP226-201 | ENST00000364912 | 300 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1072P-201 | ENST00000384703 | 107 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-443P-201 | ENST00000384780 | 107 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP338-201 | ENST00000410495 | 85 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1328P-201 | ENST00000410938 | 106 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC093382.1-201 | ENST00000413311 | 379 nt | TSL 5 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL158840.1-201 | ENST00000414132 | 523 nt | TSL 3 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MORF4L1P6-201 | ENST00000418771 | 268 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Z99497.1-201 | ENST00000421282 | 135 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC006366.1-201 | ENST00000422002 | 759 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC026355.1-201 | ENST00000423466 | 587 nt | TSL 5 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC007283.2-201 | ENST00000424739 | 197 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | ZNF736P5Y-201 | ENST00000451173 | 805 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC01038-201 | ENST00000457858 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | S100A11P2-201 | ENST00000467589 | 312 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |