Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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