Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
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