Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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