Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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