Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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