Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms