Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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