Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms