Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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ECM1Q16610 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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