Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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