Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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